膜系统酵母文库常见问题解析
发布时间：
2021-01-22 09:04
来源：
1、酵母双杂实验过程中如何选择核体系或者膜体系？
主要是根据所关注的诱饵蛋白在细胞内的定位情况来确定：
1) 诱饵基因是定位在膜上的蛋白，则选择膜体系文库；
2) 诱饵基因是定位于核，则选择核体系文库；
3) 诱饵基因是定位在细胞质，可以选择核体系或者膜体系文库
2、分离泛素膜系统的优点有哪些？缺陷有哪些？
分离的泛素系统优点
研究的蛋白质之间的相互作用发生在细胞膜或细胞质，而不是细胞核中 , 因此使得在细胞质和细胞膜中行使生理功能的蛋白质相互作用的研究得到广泛的应用， 在一定程度上弥补了传统的酵母双杂交系统的缺陷。
报告蛋白也可以选用其他性质的蛋白 (如酶 ) ，这样就可以通过检测酶活性来分析蛋白质间的相互作用。
分离的泛素系统的局限
在文库筛选结合蛋白时通常存在着假阳性较高的缺陷。因此，用该系统筛选出来的相互作用蛋白尚需采用免疫共沉淀等方法进一步加以证实；
3、膜系统酵母双杂文库如何选择诱饵载体？
膜系统酵母双杂根据诱饵基因的蛋白跨膜方式选择不同的载体，可以根据如下网站预测蛋白结构进行选择：
http://www.ebi.ac.uk/Tools/pfa/phobius/
http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/
上面的这两个网站可以分析膜蛋白的细胞内和细胞外区域。
http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/
这个网站可以具体分析蛋白的信号肽序列，以及N端是否存在cleavge site。
上一页
相关内容
酵母是一种单细胞真核微生物，具有快速繁殖、基因组较小、遗传操作方便等特点，被广泛用作模式生物，研究其在不同逆境条件下的基因表达和功能。非生物胁迫包括对生物生长和发育不利的环境因素，如高温、低温、高盐、低氧、重金属、药物等。非生物胁迫条件下，酵母会启动应激反应，调节基因表达，增强抗逆性。
许多真核生物的转录激活因子均具有2个功能上独立的结构域———DNA 结 合 结 构 域 （DNA-binding domain BD） 和 DNA 激活结构域（Activation domain AD），前者特异结合于顺式作用元件上，后者实施基因表达调控功能，因此 DNA结合结构域和DNA激活结构域就可以分开使用，单独的结合结构域或转录激活结构域都不能启动下游报道基因的表达。
抗体在细胞内的表达已成功用于消除蛋白质功能。这一发现表明，该技术应对疾病治疗和功能基因组学有影响，其中预测功能未知的蛋白质基因组序列。一个主要的障碍是一些抗体在真核细胞中不起作用，大概是因为抗体在细胞质中不正确地折叠。为了克服这个问题，我们已经开发了一种使用酵母双杂交体系用于筛选细胞内功能抗体的方法。我们发现几种特征抗体在真核细胞中以双杂交形式结合它们的靶抗原，我们已经能够从在体外结合抗原的scFv组中分离细胞内结合的物质。
蛋白质表面上能让免疫系统产生抗体的区域称为抗原决定簇(也称为表位，见下图)。一般由6-12个氨基酸或碳水基团组成，可由连续序列或不连续的蛋白质三级结构组成。一个抗原可以存在许多不同的抗原决定簇，所以机体可以产生许多不同的抗体。由单个B淋巴细胞产生的只识别特定表位的抗体被称为单克隆抗体。由多种B细胞产生的、受多种抗原决定簇刺激的、能够结合多种表位的抗体称为多克隆抗体。单抗与多抗的区别可参考单抗与多抗的区别。重组抗体的生产是根据基因序列来得到单抗，通过构建稳定表达的细胞系来满足抗体量的生产。
酵母表达系统是蛋白质真核表达的常用系统之一，具有真核表达系统的许多优点，如蛋白质加工和折叠、翻译后修饰等。酵母蛋白表达的操作与哺乳动物相比相对简单。 巴斯德毕赤酵母的表达水平高于酿酒酵母，细胞可以高密度培养。巴斯德是近年来发展起来的一种较为完善的表达体系，通常用来表达外源蛋白的甲醇营养型酵母表达系统。
