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- 产品描述
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服务简介
酵母文库构建是一项将外源DNA片段(如cDNA、基因组DNA或人工设计的序列)高效插入酵母表达载体,并转化进酵母细胞群体,形成大规模克隆集合的核心技术。该文库可用于高通量筛选目标基因或研究基因功能。瑞源生物可提供以下三种建库方法:In-Gate技术、SMART技术、Gateway技术。
技术原理
In-Gate技术:
核心机制:同源重组(HR)技术。
构建含同源重组接头的线性化载体;将目的基因两端添加同源重组接头,通过一步同源重组直接连接,形成完整文库质粒
SMART技术:
核心机制:基于反转录酶的模板切换功能。
在RNA逆转录时,通过SMART引物在cDNA的5'端添加特定序列;利用LD-PCR(长距离PCR)扩增cDNA,并与线性化载体通过体内重组连接。
Gateway技术:
核心机制:依赖λ噬菌体重组酶系统(BP/LR反应)。
BP反应:将目的基因克隆到入门载体;
LR反应:通过重组酶将基因转移到目标表达载体。
酵母文库构建技术对比
In-Gate技术
SMART技术
Gateway技术
步骤
1步同源重组
逆转录+PCR+重组
2步重组(BP+LR)
耗时
较短
中等
较长(初始构建慢)
成本
较低
中等
高(试剂昂贵)
RNA需求量
高(>400 μg)
极低(>2 μg)
高(>400 μg)
保真度
高(无PCR步骤)
中(PCR可能突变)
高(无PCR)
优势
一步重组,高效快速,适合高通量筛选
高全长率(减少移码突变)
适用微量RNA样本(如稀有组织)
均一化处理提升低丰度基因检出率
克隆效率高(>95%),阅读框精准保留
可多载体穿梭(同一基因导入不同表达系统)
劣势
新技术,应用案例较少
实验条件依赖性强(如同源接头设计)
PCR扩增可能引入碱基突变或移码
操作复杂(需优化逆转录条件)
两次重组导致低丰度基因丢失
成本高(重组酶试剂昂贵)
服务优势
1、具备多种材料RNA提取方法,高质量RNA有效提高后续文库质量
2、完善的质检流程,文库进行PCR鉴定,确保文库质量
3、提供后续文库售后和下游筛库指导
4、建库一年送三险,运输损坏险、储存不当险、意外丢失险,解决后顾之忧
5、根据不同的载体需求,提供文库个性化定制
交付内容及周期
服务内容
交付周期(工作日)
交付材料
(In-Gate)酵母核/膜文库构建
RNA提取
mRNA提取
5个
酵母核文库甘油菌8 ml(分8管);酵母膜文库甘油菌4 ml(分4管)
2. 酵母核文库质粒600 μg(分6管);酵母膜文库质粒(4管 >400 ug)
3. Word文档电子版项目报告(含实验数据)
4. 文库承诺达到以下指标:
文库库容量>1*107 CFU
核文库平均插入片段1-1.5 kb (因物种而异);膜文库平均插入片段0.8 - 1.5 kb(因物种而异)
空载率<5%
cDNA合成
cDNA与接头连接
cDNA分级分离
5个
重组到酵母载体pGADT7(核)/pPR3-N(膜)上和电转化
将获得的cDNA文库电转化至大肠杆菌感受态细胞中进行克隆扩增
5个
文库检测和质粒提取
5个
数据整理和分析
2个
转录组测序、文库全测序、GO+KEGG分析
15个
(SMART)酵母核/膜/逆境文库构建
RNA提取
mRNA提取
5个
酵母文库甘油菌各4 ml(分4管)
酵母文库质粒(4管>400ug)
Word文档电子版项目报告(含实验数据)
文库承诺达到以下指标:
文库库容量>1*107 CFU
平均插入片段0.8 -1.5 kb(因物种而异)
空载率<5%
cDNA合成与接头连接(三框文库)
cDNA均一化
重组到酵母载体pGADT7(核)/pPR3-N(膜)/pYES2 - NTB(逆境)上和电转化
将获得的cDNA文库电转化至大肠杆菌感受态细胞中进行克隆扩增
文库检测和质粒提取
数据整理和分析
17个
转录组测序、文库全测序、GO+KEGG分析
15个
(Gateway)酵母核/膜文库构建
RNA提取
mRNA提取
5个
初级文库、次级文库甘油菌各4 ml(分4管)
初级文库(2管>200ug)、次级-核文库质粒(4管>400ug)、次级-膜文库质粒(4管>400ug)
Word文档电子版项目报告(含实验数据)
文库承诺达到以下指标:
文库库容量>1*107 CFU
平均插入片段0.8-1.5 kb(因物种而异)
空载率<5%
cDNA第一链合成
cDNA第二链合成
cDNA adapter的制备
cDNA与attB1重组接头连接
cDNA分级分离
BP重组(pDONR222)
电转化大肠杆菌DH10B
文库质检与质粒提取
文库质粒重组pGADT7(核)/pPR3-N(膜)电转化大肠杆菌DH10B
文库质检与质粒提取
数据整理和分析
17个
注:酵母核、膜、逆境文库构建所用载体不一样。
案例展示
收样标准
SMART建库
Gateway、In-Gate建库
取样注意事项
RNA样品
>2ug
>400ug
需要质量较好无降解的RNA。需要提供琼脂糖电泳检测胶图,能清晰的看到28S和18S两条带
植物组织(根茎叶种子)
单个样品重量>2g,需要至少一份备份样品
单个样品重量>10g,需要至少一份备份样品
(叶片/花/茎/种子)剪取适量新鲜新鲜样品;(根系)将根部泥土清洗干净后再将根系剪下来,用锡箔纸包好或者放入50mL离心管中,写上编号,置于液氮速冻
植物组织(果实)
单个样品重量>10g,需要至少一份备份样品
单个样品重量>50g,需要至少一份备份样品
果实样品较大,如桃肉等,利用工具将果肉切成1-2cm块状大小,用锡箔纸包好或者放入50mL离心管中,写上编号,置于液氮速冻
动物组织/昆虫
单个样品重量>2g,需要至少一份备份样品
单个样品重量>10g,需要至少一份备份样品
取适量的组织、昆虫样品,放入50mL离心管中,写上编号,置于液氮速冻
真菌
单个样品重量>2g,需要至少一份备份样品
单个样品重量>10g,需要至少一份备份样品
真菌为液培状态,离心收集去除上清,放入50mL离心管中,写上编号,置于液氮速冻,真菌为平板菌状态,需要使用封口膜封好,泡沫固定在泡沫盒内,常温或冰袋寄送。
动物细胞/PBMC
单个样品细胞>1*107 cfu,需要至少一份备份样品
单个样品细胞>1*108 cfu,需要至少一份备份样品
细胞:用PBS将细胞洗下来,600g转速离心,弃上清,收集细胞,将整个EP管置于液氮速冻。PBMC:尽量使用采集后24h内的血液进行PBMC分离;体积为500-1000ul,使用无菌管保存,如果有抗凝剂最好加入抗凝剂,放-80℃保存。
取样方法及注意事项
快速收集:样本需要在采集、制备、储存、运输中尽量做到迅速和及时性,尽可能缩短样本采集到实验的周期,从而保证样本的质量和稳定性。
低温保存(鲜样样本):采集样本离体后,如有分离步骤需要在4℃条件或冰上等低温环境下进行,分离好的样本立即置于液氮、干冰或-80℃冰箱中,并保证在实验前处于-80℃以下。
样品包装:建议样品用锡箔纸、离心管包装,使用油性记号笔填写样本编号,再装入自封袋中,避免样品包装破损样品散落。
样品寄送:样品名称简单、清晰、准确,填写好样品委托单后打印纸质版随样品一起邮寄;选择合适大小的泡沫盒,干冰用量1天(5kg),2-3天(10-20kg)3-5天(20-30kg),并密封。
声明:本公司出售产品只能用于科研目的,不得用于诊断或者治疗!