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    科研服务

    立足于生命科学,为基础研究领域科学工作者提供生物学高端技术服务

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    酵母文库构建

    酵母文库构建是一项将外源DNA片段(如cDNA、基因组DNA或人工设计的序列)高效插入酵母表达载体,并转化进酵母细胞群体,形成大规模克隆集合的核心技术。该文库可用于高通量筛选目标基因或研究基因功能。瑞源生物可提供以下三种建库方法:In-Gate技术、SMART技术、Gateway技术。

    • 产品描述
    • 服务简介

      酵母文库构建是一项将外源DNA片段(如cDNA、基因组DNA或人工设计的序列)高效插入酵母表达载体,并转化进酵母细胞群体,形成大规模克隆集合的核心技术。该文库可用于高通量筛选目标基因或研究基因功能。瑞源生物可提供以下三种建库方法:In-Gate技术、SMART技术、Gateway技术。

       

      技术原理

      In-Gate技术:

      核心机制:同源重组(HR)技术。

      构建含同源重组接头的线性化载体;将目的基因两端添加同源重组接头,通过一步同源重组直接连接,形成完整文库质粒

      SMART技术:

      核心机制:基于反转录酶的模板切换功能。

      在RNA逆转录时,通过SMART引物在cDNA的5'端添加特定序列;利用LD-PCR(长距离PCR)扩增cDNA,并与线性化载体通过体内重组连接。

      Gateway技术:

      核心机制:依赖λ噬菌体重组酶系统(BP/LR反应)。

      BP反应:将目的基因克隆到入门载体;

      LR反应:通过重组酶将基因转移到目标表达载体。

       

      酵母文库构建技术对比

       

      In-Gate技术

      SMART技术

      Gateway技术

      步骤

      1步同源重组

      逆转录+PCR+重组

      2步重组(BP+LR)

      耗时

      较短

      中等

      较长(初始构建慢)

      成本

      较低

      中等

      高(试剂昂贵)

      RNA需求量

      高(>400 μg)

      极低(>2 μg)

      高(>400 μg)

      保真度

      高(无PCR步骤)

      中(PCR可能突变)

      高(无PCR)

      优势

      一步重组,高效快速,适合高通量筛选

      高全长率(减少移码突变)

      适用微量RNA样本(如稀有组织)

      均一化处理提升低丰度基因检出率

      克隆效率高(>95%),阅读框精准保留

      可多载体穿梭(同一基因导入不同表达系统)

      劣势

      新技术,应用案例较少

      实验条件依赖性强(如同源接头设计)

      PCR扩增可能引入碱基突变或移码

      操作复杂(需优化逆转录条件)

      两次重组导致低丰度基因丢失

      成本高(重组酶试剂昂贵)

       

      服务优势

      1、具备多种材料RNA提取方法,高质量RNA有效提高后续文库质量

      2、完善的质检流程,文库进行PCR鉴定,确保文库质量

      3、提供后续文库售后和下游筛库指导

      4、建库一年送三险,运输损坏险、储存不当险、意外丢失险,解决后顾之忧

      5、根据不同的载体需求,提供文库个性化定制

       

      交付内容及周期

       

      服务内容

      交付周期(工作日)

      交付材料

      (In-Gate)酵母核/膜文库构建

      RNA提取

      mRNA提取

      5个

      酵母核文库甘油菌8 ml(分8管);酵母膜文库甘油菌4 ml(分4管)

      2. 酵母核文库质粒600 μg(分6管);酵母膜文库质粒(4管 >400 ug)

      3. Word文档电子版项目报告(含实验数据)

      4. 文库承诺达到以下指标:

      文库库容量>1*107 CFU

      核文库平均插入片段1-1.5 kb (因物种而异);膜文库平均插入片段0.8 - 1.5 kb(因物种而异)

      空载率<5%

      cDNA合成

      cDNA与接头连接

      cDNA分级分离

      5个

      重组到酵母载体pGADT7(核)/pPR3-N(膜)上和电转化

      将获得的cDNA文库电转化至大肠杆菌感受态细胞中进行克隆扩增

      5个

      文库检测和质粒提取

      5个

      数据整理和分析

      2个

      转录组测序、文库全测序、GO+KEGG分析

      15个

      (SMART)酵母核/膜/逆境文库构建

      RNA提取

      mRNA提取

      5个

      酵母文库甘油菌各4 ml(分4管)

      酵母文库质粒(4管>400ug)

      Word文档电子版项目报告(含实验数据)

      文库承诺达到以下指标:

      文库库容量>1*10CFU

      平均插入片段0.8 -1.5 kb(因物种而异)

      空载率<5%

      cDNA合成与接头连接(三框文库)

      cDNA均一化

      重组到酵母载体pGADT7(核)/pPR3-N(膜)/pYES2 - NTB(逆境)上和电转化

      将获得的cDNA文库电转化至大肠杆菌感受态细胞中进行克隆扩增

      文库检测和质粒提取

      数据整理和分析

      17个

      转录组测序、文库全测序、GO+KEGG分析

      15个

      (Gateway)酵母核/膜文库构建

      RNA提取

      mRNA提取

      5个

      初级文库、次级文库甘油菌各4 ml(分4管)

      初级文库(2管>200ug)、次级-核文库质粒(4管>400ug)、次级-膜文库质粒(4管>400ug)

      Word文档电子版项目报告(含实验数据)

      文库承诺达到以下指标:

      文库库容量>1*107 CFU

      平均插入片段0.8-1.5 kb(因物种而异)

      空载率<5%

      cDNA第一链合成

      cDNA第二链合成

      cDNA adapter的制备

      cDNA与attB1重组接头连接

      cDNA分级分离

      BP重组(pDONR222)

      电转化大肠杆菌DH10B

      文库质检与质粒提取

      文库质粒重组pGADT7(核)/pPR3-N(膜)电转化大肠杆菌DH10B

      文库质检与质粒提取

      数据整理和分析

      17个

      注:酵母核、膜、逆境文库构建所用载体不一样。

       

      案例展示

       

       

       

      收样标准

       

      SMART建库

      Gateway、In-Gate建库

      取样注意事项

      RNA样品

      >2ug

      >400ug

      需要质量较好无降解的RNA。需要提供琼脂糖电泳检测胶图,能清晰的看到28S和18S两条带

      植物组织(根茎叶种子)

      单个样品重量>2g,需要至少一份备份样品

      单个样品重量>10g,需要至少一份备份样品

      (叶片/花/茎/种子)剪取适量新鲜新鲜样品;(根系)将根部泥土清洗干净后再将根系剪下来,用锡箔纸包好或者放入50mL离心管中,写上编号,置于液氮速冻

      植物组织(果实)

      单个样品重量>10g,需要至少一份备份样品

      单个样品重量>50g,需要至少一份备份样品

      果实样品较大,如桃肉等,利用工具将果肉切成1-2cm块状大小,用锡箔纸包好或者放入50mL离心管中,写上编号,置于液氮速冻

      动物组织/昆虫

      单个样品重量>2g,需要至少一份备份样品

      单个样品重量>10g,需要至少一份备份样品

      取适量的组织、昆虫样品,放入50mL离心管中,写上编号,置于液氮速冻

      真菌

      单个样品重量>2g,需要至少一份备份样品

      单个样品重量>10g,需要至少一份备份样品

      真菌为液培状态,离心收集去除上清,放入50mL离心管中,写上编号,置于液氮速冻,真菌为平板菌状态,需要使用封口膜封好,泡沫固定在泡沫盒内,常温或冰袋寄送。

      动物细胞/PBMC

      单个样品细胞>1*10cfu,需要至少一份备份样品

      单个样品细胞>1*108 cfu,需要至少一份备份样品

      细胞:用PBS将细胞洗下来,600g转速离心,弃上清,收集细胞,将整个EP管置于液氮速冻。PBMC:尽量使用采集后24h内的血液进行PBMC分离;体积为500-1000ul,使用无菌管保存,如果有抗凝剂最好加入抗凝剂,放-80℃保存。

       

      取样方法及注意事项

      快速收集:样本需要在采集、制备、储存、运输中尽量做到迅速和及时性,尽可能缩短样本采集到实验的周期,从而保证样本的质量和稳定性。

      低温保存(鲜样样本):采集样本离体后,如有分离步骤需要在4℃条件或冰上等低温环境下进行,分离好的样本立即置于液氮、干冰或-80℃冰箱中,并保证在实验前处于-80℃以下。

      样品包装:建议样品用锡箔纸、离心管包装,使用油性记号笔填写样本编号,再装入自封袋中,避免样品包装破损样品散落。

      样品寄送:样品名称简单、清晰、准确,填写好样品委托单后打印纸质版随样品一起邮寄;选择合适大小的泡沫盒,干冰用量1天(5kg),2-3天(10-20kg)3-5天(20-30kg),并密封。

       

       

    声明:本公司出售产品只能用于科研目的,不得用于诊断或者治疗!

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