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- 产品描述
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▼ 技术简介
将给定的基因数据库通过计算机进行蛋白三维模型的构建，形成蛋白三维结构库。利用ESMFold对短序列快速无模板建模，结合Swiss-Model处理长序列同源建模，形成更加全面且高效的三维结构建库
▼ 应用场景
在蛋白互作验证、药物靶点筛选及功能机制研究等生物研究领域，蛋白质三维结构的准确预测是理解蛋白功能及设计互作实验的关键步骤。
本建模方案适用于：
1、 蛋白-蛋白互作界面分析
2、 蛋白-核酸互作验证
3、 小分子药物靶点结构优化
▼ 技术优势
1、高通量构建：针对不同长度蛋白质序列，匹配最优建模工具（长度≤700aa，ESMFold建模；长度＞700aa，Swiss model建模），实现快速、高精度建模，满足蛋白互作验证及药物靶点筛选等生物研究需求
2、文库覆盖率高：文库可覆盖物种CDS全长，建模成功率98%以上，并能实现转录因子数字文库、激素相关基因等特定文库构建，如生长素赤霉素相关基因文库、分蘖相关基因文库构建
3、可靠的置信度分析：针对建模结果进行评分，建模评分≥30%，模型准确率高达80%以上，为下游筛选提供高质量模型
4、后续服务保障：提供后续数字化筛库服务
▼ 样品接收标准
1、全基因组文库：参考基因组序列
2、转录因子文库：转录因子基因序列
3、特定性文库：特定基因序列▼ 交付内容
▼ 已有文库物种
部分转录因子数字文库
物种 拉丁名 TF数量 大豆 glycine max 6150 大麦 Hordeum vulgare 2620 番茄 Solanum lycopersicum 1845 马铃薯 Solanum tuberosum 2405 毛果杨 Populus trichocarpa 4224 陆地棉 Gossypium hirsutum 5022 木薯 Manihot esculenta 2676 苹果 Malus domestica 3119 小麦 Triticum aestivum 3606 玉米 Zea mays 3308 想了解更多已有文库，请联系客服或咨询区域业务人员
部分全基因组数字文库
物种 拉丁名 全基因 拟南芥 Arabidopsis thaliana 27434 大豆 Glycine max 55799 水稻 Oryza sativa 43649 玉米 Zea mays 39299 铁皮石斛 Dendrobium nobile 29000 柑橘黄龙病菌亚洲种 Candidatus Liberibacter asiaticus str psy62 1102 智人 Homo sapiens 23391 小家鼠 Mus musculus 21615 褐家鼠 Rattus norvegicus 21270 斑马鱼 Danio rerio 24664 想了解更多已有文库，请联系客服或咨询区域业务人员
某特定性数字文库
物种 拉丁名 特性 数量 香蕉 Musa acuminata 生长素赤霉素相关基因 3528
▼ 案例展示
▼ 文献案例
Waterhouse et al., (2018) "Swiss-Model: Homology Modelling of Protein Structures and Complexes." Nucleic Acids Research
Lin Z et al., (2023) "Evolutionary-scale protein language models for structure prediction." Nature
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