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瑞源医学
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- 产品描述
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服务简介
邻近标记技术是一种在活细胞中实时标记蛋白质相互作用和空间邻近蛋白的高通量分析方法。通过将生物素连接酶(如TurboID)与目标蛋白融合表达,在添加生物素的条件下,酶活催化生物素共价标记邻近内源蛋白,标记产物可通过链霉亲和素磁珠富集,结合质谱进行鉴定,筛选潜在相互作用蛋白。该技术突破了传统免疫共沉淀无法捕获弱/瞬时相互作用的局限,为蛋白质互作网络、亚细胞蛋白质组学及药物靶点发现提供了有力工具。

技术体系
1、目标基因融合载体构建
2、细胞转染与表达验证
3、生物素标记与细胞裂解
4、链霉亲和素磁珠富集
5、Western Blot初步验证/质谱鉴定
6、生物信息学分析(针对质谱数据)
服务优势
技术优势 平台优势 1、高时空分辨率 1、细胞平台:承接多种细胞系及原代细胞,培养转染经验丰富 2、捕获弱/瞬时互作 2、全流程闭环:载体构建、标记、富集到质谱分析,一站式完成 3、兼容多种样本 3、数据透明:交付实验报告、原始数据及生信分析,完整可追溯 4、灵活检测 4、标准验证:以293T细胞为例,SOP成熟,转染效率高、背景低 应用场景
1、蛋白质相互作用网络解析
2、空间分辨的蛋白互作定位
3、药物靶点邻近蛋白鉴定
4、病原-宿主相互作用机制
5、疾病相关蛋白复合物分析
服务内容
服务项目 服务内容 自然日 交付材料 载体 A、基因合成
B、载体构建
10个 1、原始数据、结果图片;
2、标准实验报告(含实验步骤、流程);
3、含有目的基因的质粒及测序报告。
293T瞬时表达 A、细胞转染
B、蛋白表达
C、生物素处理
10个 PL-WB A、提取总蛋白
B、链霉亲和素富集
C、Western Blot鉴定
10个 PL-MS A、MS鉴定
B、数据分析
C、报告撰写
15个 收样标准
类型 送样标准 运输条件 组织材料 5-10 g 干冰寄送;
干冰使用量:1天(5 kg)、2-3天(10-20 kg)、3-5天(20-30 kg)
细胞样品 3-5×107个细胞 总蛋白样品 >1mL 需要基因合成的序列 无 无 构建好的质粒
中间载体质粒
浓度>100 ng/uL,体积>20 uL;
提供载体序列和抗性,无污染。
冰袋 含构建好质粒的菌液
含中间载体质粒的菌液
体积>500 uL;
提供载体序列和抗性,无污染,去内毒。
干冰寄送;
干冰使用量:1天(5 kg)、2-3天(10-20 kg)、3-5天(20-30 kg)
平板菌 无污染 常温 抗体 IP级别抗体>30 uL 干冰寄送;
干冰使用量:1天(5 kg)、2-3天(10-20 kg)、3-5天(20-30 kg)
案例报告
1、互作结果:实验组在预期分子量处出现清晰特异条带,阴性对照组无条带,表明目的蛋白标记与富集成功。

图 WB鉴定结果
2、质谱结果
(1)GO:结果显示鉴定蛋白在生物学过程、细胞组分和分子功能三个类别中的分布情况,反映了邻近标记富集蛋白的整体功能构成。

(2)KEGG Top Map,全局代谢通路图

参考文献
[1] Ummethum H, Hamperl S. Proximity Labeling Techniques to Study Chromatin. Front Genet. 2020;11:450. Published 2020 May 12. doi:10.3389/fgene.2020.00450
[2] Özmen B, Blaschek L, Ogden M, San Segundo M, Persson S, Zheng S. Proximity labeling techniques for protein-protein interaction mapping in plants. J Biol Chem. 2025;301(8):110501. doi:10.1016/j.jbc.2025.110501
[3] Guo J, Guo S, Lu S, et al. The development of proximity labeling technology and its applications in mammals, plants, and microorganisms [published correction appears in Cell Commun Signal. 2024 Aug 16;22(1):403. doi: 10.1186/s12964-024-01750-3.]. Cell Commun Signal. 2023;21(1):269. Published 2023 Sep 30. doi:10.1186/s12964-023-01310-1
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