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    科研服务

    立足于生命科学,为基础研究领域科学工作者提供生物学高端技术服务

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    酵母反向单杂交技术服务(TF-Centered Y1H)

    基于酵母单杂交技术建立了一种以转录因子为中心鉴定其识别作用元件的技术,命名为TF- centered Y1H。该技术能够准确、快速简捷、高效的鉴定出转录因子识别的元件,在蛋白质与DNA元件的互作研究中有着广阔的应用前景。

    • 产品描述
    • 服务简介

      基于酵母单杂交技术建立了一种以转录因子为中心鉴定其识别作用元件的技术,命名为TF- centered Y1H。该技术能够准确、快速简捷、高效的鉴定出转录因子识别的元件,在蛋白质与DNA元件的互作研究中有着广阔的应用前景。

      技术优势

      1、可全面了解转录因子识别元件。

      2、可快速地鉴定一个特定转录因子结合的各种顺式作用元件。

      3、拓展了酵母单杂交的应用范围,使其既可以用于Gene-centered研究,也可以用于TF-centered 研究。

      4、TF-Centered Y1H可以用于识别转录因子结合的各种元件,且其假阳性率要远远小于Gene-centered Y1H。

      5、该方法可以发现大量新的顺式作用元件,方法简单,快速有效。

       

      服务内容

      服务内容 周期(工作日) 交付材料
      1、基因合成(密码子优化)/ 载体构建 15 天 1、阳性克隆测序结果(根据测序结果而定)
      2、Word 文档电子版项目报告 ( 含实验数据)
      3、选择 5 条 motif 做基因组扫描分析
      4、诱饵质粒
      2、诱饵质粒的自激活检测 10 天
      3、诱饵质粒与文库质粒共转
      4、酵母筛选的条件优化
      5、筛选结果测序
      20 天
      6、筛选结果回转验证
      7、数据整理和分析
      5 天
      8、基因组扫描分析
      9、数据整理分析
      5 天

       

      ▼  案例展示

      利用AtbZIP53蛋白筛选随机DNA文库(Plant Mol Biol. 2014, 86:367-380)

      bZIP转录因子是一类重要的植物转录因子,在植物的生长过程中发挥着重要的作用。迄今为止,只有少数bZIP家族成员被研究,且发现它们主要结合核心序列为“ACGT”的顺式作用元件。然而,它是否识别其他顺式作用元件,进而发挥相应的生物学功能,尚不清楚,所以我们选择bZIP53筛选随机DNA文库,共获得一个未知元件和5个已知的DNA序列。

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      ▼ 常见FAQ

      1、为何合成两条含有插入序列的引物?

      共有3×47即49512种序列。

      2、为何仅仅构建随机序列为7bp的文库?

      因为对于新的元件需要确定边界,插入序列越长,确定边界工作量越大。这样可以减少确定新元件边界的工作量。

      3、为何将随机序列插入SmaI酶切位点?

      因为其酶切序列为CCCGGG,这个序列正好可以作为识别插入序列的标记位点,即形成了CCCHNNNNNNCGGG,CCC和GGG为标记位点。

       

      TF-Centered Y1H  Y1H  反向酵母单杂交  酵母单杂交

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