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酵母膜系统双杂交文库筛选及验证
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酵母单杂交技术是在酵母双杂基础上发展而来的一种研究核酸 - 蛋白相互作用的工具,被广泛用于研究真核细胞内基因的表达调控,如鉴别 DNA 结合位点发现潜在的结合蛋白基因、分析 DNA 结合结构域信息等。
酵母文库构建(SMART 技术)
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酵母文库构建(Gateway 技术)
Gateway 技术是由 Invitrogen 于 1999 年开发的,最初用于构建无限制性酶切位点的克隆载体,后来也用于构建酵母文库。Gateway 技术的原理是利用细菌噬菌体 λ 的重组系统,将特异性的重组序列加到 DNA 片段的两端,从而实现不同载体间的 DNA 转移
酵母反向单杂交技术服务(TF-Centered Y1H)
基于酵母单杂交技术建立了一种以转录因子为中心鉴定其识别作用元件的技术,命名为TF- centered Y1H。该技术能够准确、快速简捷、高效的鉴定出转录因子识别的元件,在蛋白质与DNA元件的互作研究中有着广阔的应用前景。
酵母逆境基因筛选及验证
酵母高通量抗逆基因筛选服务能够快速筛选岀非模式抗逆物种资源中的多重逆境抗性相关的大量基因,利用酵母菌,在逆境筛选系统下,通过抗性梯度实验对基因组范围内的抗性相关基因进行筛查,利用蛋白组学寻找候选蛋白,进行蛋白水平上的表型验证。
丹参(Salviamiltiorrhiza)是重要的药用植物,其有效成分(如丹参酮、丹酚酸)具有显著的心血管保护作用。本项目旨在建立高效的丹参遗传转化体系,通过农杆菌介导法将外源基因(如报告基因GUS或功能基因)导入丹参基因组,为后续基因功能研究及优良性状分子育种提供技术基础。
LC-MS/MS代谢组学由于其灵敏度高、通用性强、无需化学衍生等优点,近年来得到了广泛的应用。基于高分辨LC-MS/MS非靶向代谢组学平台,对生物样本中提取到的代谢小分子化合物进行大规模、无偏向性检测,对代谢物的质谱峰强度值进行定量分析,将代谢物的碎片图谱与本地标准品二级谱图数据库进行匹配得到物质鉴定结果。
真核有参转录组核心是以已注释的完整真核生物参考基因组为“坐标模板”,通过高通量测序(如 RNA-seq)捕获细胞内的全部转录本,再通过序列比对、注释、定量等生物信息学分析,解析转录本的结构、表达水平及调控规律。可以解决转录图谱的绘制、基因差异表达模式及进化分析等各方面研究问题,已经被广泛应用于临床诊断和药物研发等诸多领域。
Pull down MS是用于研究蛋白质与DNA或其他蛋白质之间相互作用的两种技术的组合: Pull down(下拉):利用一种“诱饵”分子从复杂的生物样品(如细胞裂解液)中特异性地“钓出”与其直接或间接相互作用的“猎物”分子。 MS(质谱分析):使用质谱技术对钓取的“猎物”进行定性和定量分析,从而发现新的相互作用蛋白。
蛋白质-蛋白质相互作用(Protein Protein Interaction,PPI)是指蛋白质之间通过物理接触或化学连接进行相互作用的现象。这种相互作用在细胞的生理活动中起着至关重要的作用,如信号传导、代谢路径、基因表达调控等。传统的PPI预测方法依赖于实验手段,如酵母双杂交(Y2H)和免疫共沉淀(Co-IP),这些方法尽管准确性高,但通常耗时、成本高且适用范围有限。为了应对这一挑战,计算生物学家开发了基于计算方法的PPI预测工具,这些工具可以根据蛋白质的序列或结构信息预测可能的相互作用。
4D蛋白质组学是基于新一代timsTOF Pro2质谱仪,通过捕集离子淌度(TIMS)与同步累积连续碎裂(PASEF)扫描模式进行差异定量蛋白质组学研究。以更少上样量、更快扫描速度,实现蛋白质组、修饰组学在覆盖深度、灵敏度、通量方面的全面性提升。
南京瑞源生物基于自主优化的引物设计算法和标准化实验流程,提供高精度、高通量的KASP基因分型服务。结合自动化实验平台与专业生信分析团队,可覆盖植物育种、疾病关联分析、功能基因验证等多个领域,支持从单样本(≥22)到数千样本的灵活检测需求。