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酵母逆境基因筛选及验证
酵母高通量抗逆基因筛选服务能够快速筛选岀非模式抗逆物种资源中的多重逆境抗性相关的大量基因,利用酵母菌,在逆境筛选系统下,通过抗性梯度实验对基因组范围内的抗性相关基因进行筛查,利用蛋白组学寻找候选蛋白,进行蛋白水平上的表型验证。
酵母反向单杂交技术服务(TF-Centered Y1H)
基于酵母单杂交技术建立了一种以转录因子为中心鉴定其识别作用元件的技术,命名为TF- centered Y1H。该技术能够准确、快速简捷、高效的鉴定出转录因子识别的元件,在蛋白质与DNA元件的互作研究中有着广阔的应用前景。
酵母单杂交技术是在酵母双杂基础上发展而来的一种研究核酸 - 蛋白相互作用的工具,被广泛用于研究真核细胞内基因的表达调控,如鉴别 DNA 结合位点发现潜在的结合蛋白基因、分析 DNA 结合结构域信息等。
SMART 技术是由 Clontech 于 1996 年开发的,SMART 技术的名称来源于 switching mechanism at 5’ end of RNA template 的缩写,最初用于构建哺乳动物 cDNA 文库,后来也用于构建酵母 cDNA 文库。SMART 技术的原理是利用反转录酶的模板切换活性,将特异性的序列加到 cDNA 的 5’端,从而提高全长克隆的效率。
Gateway 技术是由 Invitrogen 于 1999 年开发的,最初用于构建无限制性酶切位点的克隆载体,后来也用于构建酵母文库。Gateway 技术的原理是利用细菌噬菌体 λ 的重组系统,将特异性的重组序列加到 DNA 片段的两端,从而实现不同载体间的 DNA 转移
转录因子文库是一种包含了多种转录因子的集合,通过收集一系列转录因子的开放阅读框(ORF)克隆,这些克隆是通过各种遗传学和分子生物学技术获得的cDNA。有了转录因子文库可以直接将转录因子基因构建于载体中,便于进行下一步的筛选。
免疫沉淀-质谱分析技术服务(IP-MS)
免疫沉淀-质谱分析技术(IP-MS)是一种基于抗体和抗原特异性结合的原理研究蛋白间互作的技术。通过能与目的蛋白结合的磁珠孵化,将能与目的蛋白结合的蛋白与其他蛋白组分分离,再通过与质谱联用,对这些分离出来的蛋白组分进行定性鉴定。
荧光素酶互补(LCA)是一种用来研究蛋白质之间的相互作用,将荧光素酶分为N端和C端两个部分,分别与不同的蛋白连接,在蛋白之间存在互作的情况下形成完整的荧光素酶,因此可以通过观察荧光信号来评估蛋白质之间的相互作用。
双分子荧光互补(Bimo-lecular fluorescence complementation,简称BiFC),将荧光蛋白分割成两个不具有荧光活性的分子片段(N-fragment、C-fragment),将这两个荧光蛋白的片段分别融合两个目标蛋白A、B,如果A与B蛋白发生了相互作用,在空间上互相靠近,就会重新构建成完整的具有活性的荧光蛋白分子,在激发光的激发下,荧光蛋白发出荧光。反之,若A与B蛋白之间没有相互作用,则不能被激发岀荧光。
AI多模态蛋白筛选化合物技术服务
蛋白质与小分子间的相互作用非常重要,因为它们通常涉及药物的作用机制、酶的底物识别、信号传导等生物学过程。通过分子动力学模拟可以实现蛋白质-小分子化合物间的虚拟对接。
南京瑞源生物在蛋白质组学领域,机器学习和深度学习被广泛应用于蛋白质互作、蛋白质-核酸互作、蛋白质-小分子对接等。瑞源生物数字化文库筛选技术,根据蛋白质三维结构对蛋白质互作进行预测。根据预测得到的互作概率进行进一步实验验证,大大提升验证
酵母表达系统是研究真核蛋白质表达和分析的有力工具,毕赤酵母表达系统是近年来发展迅速、应用广泛的一种真核表达系统。 酵母具有与其他真核生物类似的蛋白质分泌途径,外源基因的分泌表达, 不仅方便了表达产物的分离纯化, 同时具有翻译后产物的修饰能力。