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酵母逆境基因筛选及验证
酵母高通量抗逆基因筛选服务能够快速筛选岀非模式抗逆物种资源中的多重逆境抗性相关的大量基因,利用酵母菌,在逆境筛选系统下,通过抗性梯度实验对基因组范围内的抗性相关基因进行筛查,利用蛋白组学寻找候选蛋白,进行蛋白水平上的表型验证。
酵母反向单杂交技术服务(TF-Centered Y1H)
基于酵母单杂交技术建立了一种以转录因子为中心鉴定其识别作用元件的技术,命名为TF- centered Y1H。该技术能够准确、快速简捷、高效的鉴定出转录因子识别的元件,在蛋白质与DNA元件的互作研究中有着广阔的应用前景。
酵母单杂交技术是在酵母双杂基础上发展而来的一种研究核酸 - 蛋白相互作用的工具,被广泛用于研究真核细胞内基因的表达调控,如鉴别 DNA 结合位点发现潜在的结合蛋白基因、分析 DNA 结合结构域信息等。
SMART 技术是由 Clontech 于 1996 年开发的,SMART 技术的名称来源于 switching mechanism at 5’ end of RNA template 的缩写,最初用于构建哺乳动物 cDNA 文库,后来也用于构建酵母 cDNA 文库。SMART 技术的原理是利用反转录酶的模板切换活性,将特异性的序列加到 cDNA 的 5’端,从而提高全长克隆的效率。
Gateway 技术是由 Invitrogen 于 1999 年开发的,最初用于构建无限制性酶切位点的克隆载体,后来也用于构建酵母文库。Gateway 技术的原理是利用细菌噬菌体 λ 的重组系统,将特异性的重组序列加到 DNA 片段的两端,从而实现不同载体间的 DNA 转移
AI多模态蛋白筛选化合物技术服务
蛋白质与小分子间的相互作用非常重要,因为它们通常涉及药物的作用机制、酶的底物识别、信号传导等生物学过程。通过分子动力学模拟可以实现蛋白质-小分子化合物间的虚拟对接。
南京瑞源生物在蛋白质组学领域,机器学习和深度学习被广泛应用于蛋白质互作、蛋白质-核酸互作、蛋白质-小分子对接等。瑞源生物数字化文库筛选技术,根据蛋白质三维结构对蛋白质互作进行预测。根据预测得到的互作概率进行进一步实验验证,大大提升验证
酵母表达系统是研究真核蛋白质表达和分析的有力工具,毕赤酵母表达系统是近年来发展迅速、应用广泛的一种真核表达系统。 酵母具有与其他真核生物类似的蛋白质分泌途径,外源基因的分泌表达, 不仅方便了表达产物的分离纯化, 同时具有翻译后产物的修饰能力。
南京瑞源生物开发了多个全面涵盖不同物种转录因子(TF)的数字化模拟文库,适用于数字化筛选技术。数字化筛库是一种利用计算机进行高通量文库筛选的方法,可以快速、高效、全面地发现与特定蛋白互作的基因。
原核蛋白表达系统是一种常用的表达系统,其中以大肠杆菌表达系统最具代表性。大肠杆菌表达系统是最早被应用的蛋白表达系统,也是目前掌握最为成熟的表达系统。大肠杆菌具有遗传背景清晰,成本低,表达量高,表达产物的分离纯化相对简单等众多优势,能快速表达不同种属来源的外源基因。但原核表达体系也存在易形成包涵体和含有内毒素等问题,瑞源生物可提供从密码子优化、蛋白表达、包涵体复性到标签去除等一站式服务,同时可提供内毒素含量检测服务。
遗传报告基因系统目前广泛应用于真核基因表达和细胞生理学研究,单报告基因实验往往会受到各种实验条件的影响,双报告基因常被用来提高实验准确性。 “双报告基因”指在一个系统中同时表达和测量两种单独的报告基因酶,通常,实验报告基因与特定实验条件产生的效应相关,共转染“对照”报告基因则为实验提供基准线,有效减少外在因素对实验结果产生的影响,提高实验数据可信度。
南京瑞源生物采用先进的Illumina测序平台,快速、高效地读取高质量的测序数据,以精准快捷为核心,准确检测样品间的重要变异信息,对候选基因进行注释后能通过荧光定量PCR、EMSA、酵母单杂、酵母双杂等实验进行候选基因验证。仅需客户提供原始材料,南京瑞源生物进行建库测序、BSA分析、基因挖掘、功能验证一条龙服务,节约客户等待时间。