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酵母逆境基因筛选及验证
酵母高通量抗逆基因筛选服务能够快速筛选岀非模式抗逆物种资源中的多重逆境抗性相关的大量基因,利用酵母菌,在逆境筛选系统下,通过抗性梯度实验对基因组范围内的抗性相关基因进行筛查,利用蛋白组学寻找候选蛋白,进行蛋白水平上的表型验证。
酵母反向单杂交技术服务(TF-Centered Y1H)
基于酵母单杂交技术建立了一种以转录因子为中心鉴定其识别作用元件的技术,命名为TF- centered Y1H。该技术能够准确、快速简捷、高效的鉴定出转录因子识别的元件,在蛋白质与DNA元件的互作研究中有着广阔的应用前景。
酵母单杂交技术是在酵母双杂基础上发展而来的一种研究核酸 - 蛋白相互作用的工具,被广泛用于研究真核细胞内基因的表达调控,如鉴别 DNA 结合位点发现潜在的结合蛋白基因、分析 DNA 结合结构域信息等。
SMART 技术是由 Clontech 于 1996 年开发的,SMART 技术的名称来源于 switching mechanism at 5’ end of RNA template 的缩写,最初用于构建哺乳动物 cDNA 文库,后来也用于构建酵母 cDNA 文库。SMART 技术的原理是利用反转录酶的模板切换活性,将特异性的序列加到 cDNA 的 5’端,从而提高全长克隆的效率。
Gateway 技术是由 Invitrogen 于 1999 年开发的,最初用于构建无限制性酶切位点的克隆载体,后来也用于构建酵母文库。Gateway 技术的原理是利用细菌噬菌体 λ 的重组系统,将特异性的重组序列加到 DNA 片段的两端,从而实现不同载体间的 DNA 转移
转录因子文库是一种包含了多种转录因子的集合,通过收集一系列转录因子的开放阅读框(ORF)克隆,这些克隆是通过各种遗传学和分子生物学技术获得的cDNA。有了转录因子文库可以直接将转录因子基因构建于载体中,便于进行下一步的筛选。
Cre-LoxP原理的大规模蛋白互作筛选技术,这是一种以酵母双杂筛库体系为基础,用来筛选蛋白质相互作用的高通量方法。
南京瑞源生物提供酵母信号肽筛选及验证信号肽分泌功能服务。试验中选用的酵母菌株为缺失蔗糖转化酶基因、在以蔗糖为唯一碳源的培养基上不能生长的 YTK12。选用的载体质粒为含有色氨酸合成基因和一个缺失信号肽与起始密码子 ATG 的蔗糖转化酶基因(SUC2)的 pSUC2。 当一个具有功能的信号肽连接到 pSUC2的蔗糖转化酶基因之前时可以恢复蔗糖转化酶的分泌功能,从而使 YTK12菌株可在以棉子糖为碳源的缺陷型培养基上生长。 此外, TTC显色反应也常用于验证结果。
多肽文库筛选技术服务
南京瑞源生物通过构建长度为6肽的随机多肽文库,有 18 个碱基的随机插入位点,库容达 108cfu,利用该随机多肽文库作为猎物,研究的目的蛋白作为诱饵进行双杂筛选,适应于蛋白质组学规模上快速、系统地研究多肽结合结构域的结合特性和筛选其互作蛋白,为相关蛋白的生物学功能研究以及相关疾病的发病机制研究提供了重要线索依据。
酵母三杂交技术是由酵母双杂交技术改进而来的,这套系统引进了一个pBridge的质粒,这个质粒的特点是能够同时插入两个外源蛋白,在MCSI插入的蛋白的N端仍然融合Gal4系统中的BD结合域氨基酸多肽片段,而在MCSII中插入的蛋白不融合任何标签,但是在其上游有一个Pmet25启动子,这个启动子的特点是只有在甲硫氨酸(Met)缺乏的时候才能工作,使下游蛋白基因表达,所以必须要在甲硫氨酸缺陷型培养基中进行实验。
泛素作为降解信号分子,可以连接另外一种蛋白质的N端,然后被泛素专一性蛋白酶(UBPs)识别,从而导致与泛素相连的蛋白被酶解。在膜双杂体系中泛素被分为两部分:N端(Nub),C端(Cub)。泛素Nub的3位异亮氨酸突变为甘氨酸(NubI突变为NubG)。
酵母双杂交系统是一种鉴定活细胞内蛋白质相互作用的研究方法,其原理是:Gal4 转录因子由 DNA 结合域(binding domain,BD)和转录激活域(active domain,AD)组成,二者可以分开独立表达为有功能的蛋白。当二者在物理空间上靠近时可以表现出完整的转录因子活性,基于此,把目的蛋白分别与 BD、AD 融合表达,当目的蛋白发生互作时,使得 BD、AD 在物理空间可以靠近,这时就能够表现出完整的转录因子功能,从而激活下游基因的表达。 酵母双杂文库筛选及验证