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瑞源医学
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- 产品描述
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服务简介
本服务基于染色质免疫沉淀技术（ChIP），结合高通量测序（Seq），用于研究蛋白质与DNA在哺乳动物细胞中的相互作用。适用于转录因子结合位点、组蛋白修饰等表观遗传学分析。
技术体系
载体构建 → 瞬时表达转染 → 目的蛋白WB鉴定 → ChIP富集 → 解交联与DNA纯化 → 测序（默认6G）→ 数据分析（peak calling、motif分析、GO/KEGG富集）
技术优势
1．实验与测序无缝衔接，交付完整数据分析报告，结果直接可用。
2．样本适用性广，覆盖多种哺乳动物细胞及组织样本。
3．实验全流程自主可控，数据真实可靠。
4．载体构建到数据分析一站式服务，专业团队提供完整实验方案。
服务内容
服务项目
服务内容
自然日
交付材料
载体构建工作
A、载体构建
B、基因合成
C、原质粒测序
10个
A、载体构建：无；
B、基因合成：质粒、甘油菌；
瞬时表达转染
A、细胞培养；
B、质粒抽提；
C、细胞转染；
D、瞬时表达；
10个
A、阳性鉴定结果图；
目的基因表达鉴定
A、目的蛋白提取；
B、目的蛋白WB鉴定；
10个
A、目的蛋白WB鉴定图；
ChIP-Seq
A、组织交联；
B、ChIP富集；
C、诱饵蛋白鉴定；
D、解交联与DNA纯化；
E、Seq测序。
10个
A、诱饵蛋白的WB检测图；
B、ChIP实验报告。
收样标准
类型 送样标准 运输条件 需要基因合成的序列 无 无 构建好的/中间载体质粒 浓度>200 ng/uL，体积>20 uL；
提供载体序列和抗性，无污染。
冰袋 含构建好质粒/含中间载体质粒的菌液 体积>500 uL；
提供载体序列和抗性，无污染。
干冰寄送
干冰使用量：1天（5 kg）、2-3天（10-20 kg）、3-5天（20-30 kg）
平板菌 无污染 常温 抗体 （常见标签抗体无需提供） IP级别抗体>30uL 干冰寄送
干冰使用量：1天（5 kg）、2-3天（10-20 kg）、3-5天（20-30 kg）
动物组织 质量：5-7g；
PBS清洗后，滤纸吸干液体，用无菌剪刀剪成碎片（越小越好），收集到15 mL离心管中，液氮速冻5 min以上，-80 ℃保存。
动物细胞 3-5×107个/细胞 冰袋 应用场景
1.验证特定转录因子在目标基因启动子区域的结合。
2.研究组蛋白修饰（如H3K4me3，H3K27ac）在基因组特定区域的富集情况。
3.解析表观遗传调控机制，如DNA甲基化与组蛋白修饰的相互关系。
4.在药物开发中，评估化合物对靶蛋白与DNA结合能力的影响。
交付内容
交付内容 解决问题 数据质控（Raw Data QC） 过滤低质量数据，保证数据可用 基因组比对（Mapping） reads分布与比对率统计 结合位点检测（Peak Calling） 识别蛋白结合峰 基序分析（Motif Analysis） 鉴定结合序列偏好 峰注释（Peak Annotation） 关联基因元件，寻找靶基因 差异峰分析（Differential Peak Analysis） 筛选样本间显著变化区域。 功能富集（Functional Enrichment） GO、KEGG通路分析 可视化（IGV Visualization） 浏览reads堆积与差异图谱 参考文献
[1] Nakato R, Sakata T. Methods for ChIP-seq analysis: A practical workflow and advanced applications. Methods. 2021;187:44-53. doi:10.1016/j.ymeth.2020.03.005
[2] Huang X, Yip K, Nie H, et al. ChIP-seq and RNA-seq Reveal the Involvement of Histone Lactylation Modification in Gestational Diabetes Mellitus. J Proteome Res. 2024;23(6):1937-1947. doi:10.1021/acs.jproteome.3c00727
[3] Wang Y, Zhao Y, Cao G, et al. STAT3 Facilitates Super Enhancer Formation to Promote Fibroblast-To-Myofibroblast Differentiation by the Analysis of ATAC-Seq, RNA-Seq and ChIP-Seq. J Cell Mol Med. 2025;29(11):e70639. doi:10.1111/jcmm.70639
[4] Tu X, Mejía-Guerra MK, Valdes Franco JA, et al. Reconstructing the maize leaf regulatory network using ChIP-seq data of 104 transcription factors. Nat Commun. 2020;11(1):5089. Published 2020 Oct 9. doi:10.1038/s41467-020-18832-8
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