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    科研服务

    立足于生命科学,为基础研究领域科学工作者提供生物学高端技术服务

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    酵母CRISPR基因敲除

    CRISPR-Cas12a酵母基因编辑是一种利用Cas12a核酸内切酶在酵母细胞中进行基因组精准编辑的技术。其核心定义为:在crRNA引导下,Cas12a识别酵母基因组中T-richPAM序列,对靶位点进行交错切割,产生粘性末端双链断裂,随后通过酵母内源的DNA修复通路实现基因敲除或敲入。通过CRISPR技术实现酵母特定基因的定向敲除,以探究目标基因的生物学功能与作用机制。

    • 产品描述
    • 服务简介

      CRISPR-Cas12a酵母基因编辑是一种利用Cas12a核酸内切酶在酵母细胞中进行基因组精准编辑的技术。其核心定义为:在crRNA引导下,Cas12a识别酵母基因组中T-richPAM序列,对靶位点进行交错切割,产生粘性末端双链断裂,随后通过酵母内源的DNA修复通路实现基因敲除或敲入。通过CRISPR技术实现酵母特定基因的定向敲除,以探究目标基因的生物学功能与作用机制。

       

      服务优势

      1、敲除效率极高:阳性克隆获得率远超传统方法。

      2、周期短,操作便捷:无需多轮筛选。

      3、可无痕敲除:设计同源臂供体时可不引入任何抗性或标记基因,避免标记基因对后续实验的干扰。

      4、无物种限制:适用于各类酵母宿主,只需针对不同物种优化密码子和启动子。

       

      应用场景

      1、基因功能深度解析:系统性敲除候选基因,分析其在细胞周期、应激反应、自噬等生理过程中的作用。

      2、代谢通路重构:快速敲除旁路竞争基因或负调控因子,提高目标代谢产物(如乙醇、有机酸、萜类)产量。

      3、合成生物学底盘改造:对酵母基因组进行“清洗”和简化,构建最小基因组底盘,用于植入人工合成通路。

      4、药物靶标验证:在酵母模型中敲除人类疾病相关基因的同源基因,测试药物或化合物的功能回复效果。

       

      服务内容

      服务内容自然日交付材料
      质粒验证

      1、提供序列

      2、提供质粒:测序验证

      15个

      1、敲除成功的菌株甘油菌、平板;

      2、测序文件;

      3、电子版实验报告1份。

      基因敲除

      1、CRISPR敲除靶点设计

      2、敲除模块构建

      3、载体构建

      4、基因敲除

      5、菌P验证

      6、测序鉴定

      7、阳性克隆扩增

      8、结果鉴定

      63个

       

      收样标准

      类型送样标准运输条件
      需要基因合成的序列

      构建好的/

      中间载体质粒

      浓度>100 ng/uL,体积>20 uL;提供载体序列和抗性,无污染。质粒使用冰袋寄送

      含构建好质粒/

      含中间载体质粒的菌液

      提供抗性,菌液量>0.5 mL,放置一年以上的甘油菌需活化后送样。

      菌液使用干冰寄送;

      干冰使用量:1天(5 kg)2-3天(10-20 kg)3-5天(20-30 kg)

      平板菌无污染常温

      注意:1、其余类型样品请提前与我司沟通;

      2、干冰取样及运输,至少在送样前2天通知我司。

       

      案例报告

      1、转化生长情况

      电转化后涂 100 mg/L G418 的 YPD 平板上,可见密集单菌落,长斑正常(图 1)。

      图 1 转化平板

       

      2、PCR鉴定结果

      PCR 鉴定位点如下图所示(图2)。

      图 2 PCR 鉴定结果

       

      3、测序结果

      测序结果显示目标区域被精确删除,上下游同源臂正确连接(图 3)。

      图 3   敲除测序验证

       

      参考文献

      [1] Laughery MF, Wyrick JJ. Simple CRISPR-Cas9 Genome Editing in Saccharomyces cerevisiae. Curr Protoc Mol Biol. 2019;129(1):e110. doi:10.1002/cpmb.110

      [2] Kapoor SA, Choudhary P, Kasana RC. Exploring CRISPR/Cas9-Mediated Gene Editing Advances in Conventional and Non-conventional Yeast Species. Appl Biochem Biotechnol. 2025;197(11):7083-7122. doi:10.1007/s12010-025-05382-2

      [3] Holkenbrink C, Dam MI, Kildegaard KR, et al. EasyCloneYALI: CRISPR/Cas9-Based Synthetic Toolbox for Engineering of the Yeast Yarrowia lipolytica. Biotechnol J. 2018;13(9):e1700543. doi:10.1002/biot.201700543

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