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    科研服务

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    蛋白互作置信度分析体系

    南京瑞源生物自主研发蛋白互作置信度分值智能系统,用于衡量蛋白质之间相互作用可靠性的指标。研究DNA-蛋白质或蛋白质-蛋白质之间互作的置信度,并给出置信度分值,为后续实验提供参考依据。

    所属分类

    • 产品描述
    • ▼ 蛋白互作置信度分析是什么?

      南京瑞源生物自主研发蛋白互作置信度分值智能系统,用于衡量蛋白质之间相互作用可靠性的指标。

       

      蛋白互作置信度分析应用场景?

      研究DNA-蛋白质或蛋白质-蛋白质之间互作的置信度,并给出置信度分值,为后续实验提供参考依据。

       

      ▼ 蛋白互作置信度分析优势是什么?

      零实验操作与试剂费用:全自动服务,省去实验繁琐的操作和昂贵的试剂耗材开支。

      快速候选基因筛选:快速获得蛋白质互作图谱,告别长时间等待

      可靠的置信度分析:这将大大缩小互作蛋白或基因验证的范围,让您避免不必要的工作。

      符合期刊要求的图片:提供高清晰度的3D蛋白结构分析图,满足不同期刊格式要求。

      省心的后续实验:可选择提供酵母一对一验证实验服务,可以对筛选结果进行进一步的验证和定量分析,提高可信度和准确度。

       

      ▼ 蛋白互作置信度分析的流程?

      氨基酸序列或CDS全长序列---数字三维模拟建库---得到互作置信度分值

       

      ▼ 构建蛋白互作置信度分析需要提供什么?

      氨基酸序列或CDS全长序列

       

      ▼ 使用蛋白置信度分析能交付什么?

      DNA-蛋白互作:

       

      蛋白质-蛋白质互作:

       

      ▼ 参考文献

      Yan Y, Tao H, He J, Huang S-Y.* The HDOCK server for integrated protein-protein docking. Nature Protocols, 2020; doi: https://doi.org/10.1038/s41596-020-0312-x.

      Yan Y, Zhang D, Zhou P, Li B, Huang S-Y. HDOCK: a web server for protein-protein and protein-DNA/RNA docking based on a hybrid strategy. Nucleic Acids Res. 2017;45(W1):W365-W373.

      Yan Y, Wen Z, Wang X, Huang S-Y. Addressing recent docking challenges: A hybrid strategy to integrate template-based and free protein-protein docking. Proteins 2017;85:497-512.

      Huang S-Y, Zou X. A knowledge-based scoring function for protein-RNA interactions derived from a statistical mechanics-based iterative method. Nucleic Acids Res. 2014;42:e55.

      Masahito Ohue, Takehiro Shimoda, Shuji Suzuki, Yuri Matsuzaki, Takashi Ishida, Yutaka Akiyama. MEGADOCK 4.0: an ultra-high-performance protein-protein docking software for heterogeneous supercomputers,Bioinformatics, 30(22): 3281-3283, 2014.

      Takehiro Shimoda, Shuji Suzuki, Masahito Ohue, Takashi Ishida, Yutaka Akiyama. Protein-Protein Docking on Hardware Accelerators: Comparison of GPU and MIC Architectures, BMC Systems Biology, 9(Suppl 1): S6, 2015.

       

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