图片展示

FIG|山东花生研究所利用Y2H等技术揭示了花生基因组 HRS 复合体成员全基因组鉴定和表征及其对生物和非生物胁迫的反应

作者:南京瑞源生物技术有限公司 浏览: 发表时间:2021-09-29 11:08:55

然而,迄今为止,尚未对Arachis的 HRS 综合体进行系统分析。在这项研究中,在Arachis中对 HRS 复合体进行了综合分析。

中国青岛山东花生研究所研究团队利用Y2H技术在“Frontiers  in Genetics”发表了一篇名为“Genome-Wide Identification and Characterization of HSP90-RAR1-SGT1-Complex Members From Arachis Genomes and Their Responses to Biotic and Abiotic Stresses”的文章揭示了花生基因组中 HSP90-RAR1-SGT1 复合体成员的全基因组鉴定和表征及其对生物和非生物胁迫的反应


在这项研究中,在Arachis中对 HRS 复合体进行了综合分析。通过探索已发表的 RNA-seq 数据,我们发现几个 HSP90 基因在生物和非生物胁迫响应中都发挥着重要作用,尤其是盐和干旱响应。自激活试验表明,AhSGT1-B1 不能用作酵母双杂交 (Y2H) 文库筛选的诱饵。AhRAR1 和 AhSGT1 可以强烈相互作用,并与 AhHSP90-B8 相互作用。本研究代表了花生中 HRS 复杂基因的首次系统分析并为 HRS 复杂基因的功能分析提供有价值的信息。这项研究还为花生改良提供了潜在的抗逆基因


为了鉴定参与生物和非生物胁迫的基因,我们比较地重新分析了涉及对盐、干旱、低钙,以及黄曲霉感染 。结果表明几个 HSP90 基因在盐和干旱胁迫响应中发挥重要作用(图 8)。 

图 8. HRS 基因响应不同压力的转录组分析

为了表征它们的相互作用,从栽培花生花玉 9303 中分离出AhRAR1-A、AhRAR1-B、AhSGT1-B1、AhSGT1-A2、AhSGT1-B2、AhSGT1-A3、AhSGT1-B3和AhHSP90-B8,并将它们重组到 AD 中和 BD 质粒,用于使用 Gal4 系统进行 Y2H 分析。当用作猎物和诱饵蛋白时,这 8 个基因在 TDO 和 QDO 培养基上没有表现出或不显着的自激活,但在 TDO 培养基上的 AhSGT1-B1 诱饵除外(图 9)。然后我们测试了 AhRAR1-A、AhRAR1-B、AhSGT1-B1、AhSGT1-A2、AhSGT1-B2、AhSGT1-A3、AhSGT1-B3 和 AhHSP90-B8 之间所有可能的成对相互作用(图 10 )。AhHSP90-B8 在低严格培养基 (TDO) 中与 AhRAR1s 和 AhSGT1s 相互作用,但在 QDO 培养基中不相互作用。检测到 AhRAR1s 和 AhSGT1s 之间的强相互作用,如酵母在高严格培养基 (QDO) 上的生长所反映的(图 10)。

图 9. HRS 蛋白的自激活测试

图 10. HRS 蛋白质间相互作用

通常,HSP90、RAR1和SGT1可以相互作用,它们之间的相互作用对于它们在植物防御中的功能是必不可少的。在这里,从栽培花生中分离出HRS相关基因(包括AhRAR1-A、AhRAR1-B、AhSGT1-B1、AhSGT1-A2、AhSGT1-B2、AhSGT1-A3、AhSGT1-B3和AhHSP90-B8)以测试它们的自激活和使用 Y2H 测定更详细地相互作用。当用作猎物和诱饵蛋白时,除 TDO 中的 AhSGT1-B1 诱饵外,所有检测到的蛋白质在 TDO 和 QDO 培养基上均未显示或不显着的自激活。图 9 )。在大麦中也观察到了类似的结果,表明 AhSGT1-B1 不能用作文库筛选的诱饵。以往的研究表明,RAR1和SGT1在许多植物物种中相互作用很强。在这项研究中,检测到两种 AhRAR1 蛋白和三种 AhSGT1 蛋白之间的强相互作用(图 10),这可能归因于 RAR1 中的 CHORD-II 结构域与 SGT1 中的 CS 结构域的相互作用。选择 AhHSP90-B8 作为代表研究其与 AhRAR1 和 AhSGT1 的相互作用。与大麦一样,花生中的 RAR1 和 SGT1 基因与低严格培养基 (TDO) 中的 AhHSP90-B8 相互作用(图 10)。这些结果表明AhRAR1、AhSGT1和AhHSP90-B8可能在花生中共同发挥作用。


文献链接:https://doi.org/10.3389/fgene.2021.689669

FIG|山东花生研究所利用Y2H等技术揭示了花生基因组 HRS 复合体成员全基因组鉴定和表征及其对生物和非生物胁迫的反应
然而,迄今为止,尚未对Arachis的 HRS 综合体进行系统分析。在这项研究中,在Arachis中对 HRS 复合体进行了综合分析。
长按图片保存/分享
0
图片展示

电话:400-863-8520;025-5767-1761

邮箱:order@bestofbest.top

地址:南京市栖霞区仙林街道纬地路9号江苏生命科技园F7栋

图片展示

微信公众号

全资子公司

维百瑞生物

版权所有:南京瑞源生物技术有限公司|想了解酵母文库解决方案,技术服务,靠谱方法,多少钱,哪家好请联系我们.       苏ICP备20003978号

在线咨询

您好,请点击在线客服进行在线沟通!

联系方式
联系电话
400-8638520
联系电话
025-57671761
扫一扫二维码
二维码
添加微信好友,详细了解产品
使用企业微信
“扫一扫”加入群聊
复制成功
添加微信好友,详细了解产品
我知道了