Nature Comm | 中科院植物所与清华大学合作解析硅藻光系统I-捕光天线I超级复合物2.38 Å的三维结构

硅藻是海洋中的主要浮游藻类之一,是全球原初生产力的主要提供者,在地球碳氧等元素循环中起重要作用。硅藻还在油气矿藏、渔业饵料、生物产油、化妆品等行业有着巨大的经济效益。硅藻含有岩藻黄素、叶绿素c、硅甲藻黄素等与绿色光合生物不同的光合色素,因此具有特殊的光能捕获、能量传递和光保护机制。

 

中国科学院植物研究所光合膜蛋白结构生物学团队在沈建仁研究员和匡廷云院士的领导下,一直致力于光合膜蛋白三维结构和功能的研究。2019年,该团队率先破解了一种羽纹纲硅藻-三角褐指藻的FCP (Fucoxanthin Chlorophyll a/c protein)捕光天线二聚体的1.8 Å分辨率晶体结构(点击查看:Science | 中科院植物所成功解析硅藻主要捕光天线蛋白的高分辨率结构),描述了FCP中叶绿素a,叶绿素c和岩藻黄素的精确结构信息。同年,该团队与清华大学隋森芳院士团队合作进一步解析了中心纲硅藻-纤细角毛藻的光系统II-捕光天线II复合物 (Photosystem II-FCPII, PSII-FCPII) 3.0 Å的冷冻电镜结构,阐明了其光能高效传递和淬灭的结构基础(点击查看:Science | 匡廷云/沈建仁/隋森芳合作团队解析硅藻光系统II-捕光天线超级复合体原子水平三维结构)然而硅藻光系统I结合的捕光天线数量,以及核心与捕光天线的结合方式还不清楚,硅藻光系统I的光能捕获和传递机制还未得到解析。

2020年10月8日,中科院植物所沈建仁团队再次与清华大学隋森芳团队合作在Nature Communications发表了题为Structural basis for energy transfer in a huge diatom PSI-FCPI supercomplex的研究论文,该研究利用单颗粒冷冻电镜技术解析了硅藻PSI-FCPI超级复合物2.38 Å分辨率的三维结构,PSI核心分辨率高达2.2 Å,揭示了包括大量水分子在内的大量结构细节。




该研究发现,硅藻PSI-FCPI的反应中心有12个亚基,周围结合24个FCPIs。在核心亚基中,PsaA、PsaB等亚基和其他真核光合生物有较高的保守性,但丢失了PsaG、PsaH、PsaK、PsaO和PsaN亚基,新发现了PsaR和PsaS亚基,它们可能分别参与稳固外围FCPI天线和从FCPI亚基向PSI核心的能量传递。PSI-FCPI的24个FCPIs在反应中心周围围绕成三层,内层11个FCPI亚基形成一个封闭的结构,第二层的10个亚基形成半圈结构,最外层是3个亚基离核心距离达16 nm。这也是目前发现集合捕光天线最多的单体光系统。


纤细角毛藻PSI-FCPI超级复合物三维结构

a, PSI-FCPI在类囊体膜基质侧的俯视图,外围结合24个FCPI天线亚基;b, PSI-FCPI 的侧视图,基质侧发现新的PsaS亚基;c-d, PSI-FCPI分别在基质侧和囊腔侧的超大色素网络以及可能的能量传递途径。

 

PSI-FCPI结构中结合了326个叶绿素a、34个叶绿素c、102个岩藻黄素、35个硅甲藻黄素、18个β-胡萝卜素和大量电子传递体、脂质以及水分子,这与蓝藻、红藻、绿藻以及高等植物的光系统I复合物的色素组成有显著的差异,大大地增加了硅藻PSI-FCPI的捕光截面,可帮助硅藻吸收更多的蓝绿光用于光反应。精巧设计的巨大色素网络、错综排布的能量传递路径可以高效地将捕获的太阳能层层传递至硅藻光系统I的反应中心。

 

中科院植物研究所博士生徐才哲、清华大学博士后皮雄和博士生黄雅雯为本文共同第一作者,植物所沈建仁研究员、王文达研究员和清华大学隋森芳院士为本文通讯作者,匡廷云院士、河北科技大学陈晓波教授和济南大学秦晓春教授也有重要贡献。该研究得到科技部重点研发计划、国家自然科学基金、中国科学院先导项目和青促会等项目资助,得到中科院光生物学重点实验室仪器平台和清华大学冷冻电镜中心技术支持。


原文链接https://www.nature.com/articles/s41467-020-18867-x

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Nature Comm | 中科院植物所与清华大学合作解析硅藻光系统I-捕光天线I超级复合物2.38 Å的三维结构
2020年10月8日,中科院植物所沈建仁团队再次与清华大学隋森芳团队合作在Nature Communications发表了题为Structural basis for energy transfer in a huge diatom PSI-FCPI supercomplex的研究论文,该研究利用单颗粒冷冻电镜技术解析了硅藻PSI-FCPI超级复合物2.38 Å分辨率的三维结构,PSI核心分辨率高
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